MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 7674

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	TTA	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017043	TAC	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017043	AGTA	2	8	92	99	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017043	TAT	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017043	AGT	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017043	GAT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017043	CGA	2	6	479	484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017043	ATA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017043	AATT	2	8	640	647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017043	GCA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017043	AAGAA	2	10	740	749	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017043	AAG	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017043	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017043	TTA	2	6	828	833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017043	AAT	3	9	840	848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017043	TGG	2	6	925	930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017043	AGA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017043	GAG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017043	TTG	2	6	987	992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017043	GTC	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017043	GAG	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017043	A	7	7	1056	1062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017043	CAA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017043	A	6	6	1180	1185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017043	CAAAAA	2	12	1187	1198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017043	A	7	7	1194	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017043	T	6	6	6119	6124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017043	GAA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017043	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017043	TGA	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017043	TA	3	6	6841	6846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017043	A	7	7	6851	6857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017043	TCTA	2	8	9476	9483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017043	TAT	2	6	9504	9509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017043	T	6	6	9509	9514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017043	ATT	2	6	9565	9570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017043	GTT	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017043	ACC	2	6	9641	9646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017043	A	8	8	9656	9663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017043	GTA	3	9	9664	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017043	CCT	2	6	9686	9691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017043	TAAT	2	8	9936	9943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017043	TTC	2	6	10049	10054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017043	TTC	2	6	10058	10063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017043	A	7	7	10111	10117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017043	CTA	2	6	10126	10131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017043	TAA	2	6	10144	10149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017043	TAAT	2	8	10154	10161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017043	T	6	6	10172	10177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017043	TAA	2	6	10187	10192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017043	A	8	8	10223	10230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017043	A	9	9	10247	10255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017043	TAT	2	6	10276	10281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017043	AGT	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017043	TAA	2	6	10337	10342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017043	TTA	2	6	10353	10358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017043	AAT	2	6	11003	11008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017043	TG	3	6	11014	11019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017043	A	8	8	11068	11075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017043	A	6	6	11078	11083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017043	ACA	2	6	11114	11119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017043	TGC	2	6	12782	12787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017043	GCGA	2	8	12810	12817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017043	CTC	2	6	12888	12893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017043	A	6	6	15048	15053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017043	TAC	2	6	15152	15157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017043	AATATA	2	12	15228	15239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017043	AGG	2	6	16134	16139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017043	GTC	2	6	16163	16168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017043	TCA	2	6	16200	16205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017043	AAT	2	6	16206	16211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017043	TCG	2	6	16232	16237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017043	TAC	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017043	TTC	2	6	16251	16256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017043	TAA	2	6	16271	16276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017043	A	7	7	16294	16300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017043	AAG	2	6	17681	17686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017043	A	7	7	17700	17706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017043	TTG	2	6	18518	18523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017043	TTAT	2	8	18549	18556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017043	ATT	2	6	18569	18574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017043	ATC	2	6	18588	18593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017043	GAG	2	6	18599	18604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017043	TTAC	2	8	18653	18660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017043	CAA	2	6	18697	18702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017043	AAT	2	6	19624	19629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017043	TTTTA	2	10	19639	19648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017043	T	7	7	19697	19703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017043	TG	3	6	19712	19717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017043	ACA	2	6	19759	19764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017043	ATTT	2	8	20965	20972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017043	ATG	2	6	21258	21263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017043	TTA	2	6	21271	21276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017043	T	6	6	21286	21291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017043	GCT	2	6	21304	21309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017043	TCA	2	6	21322	21327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017043	TA	3	6	21349	21354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017043	ACT	3	9	21386	21394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017043	ATA	2	6	21410	21415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017043	TA	3	6	21447	21452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017043	TAT	2	6	21463	21468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017043	TAA	2	6	21530	21535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017043	TGA	2	6	21538	21543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017043	AAT	2	6	21567	21572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017043	AGC	2	6	21587	21592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017043	T	7	7	21604	21610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017043	TAAA	2	8	21655	21662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017043	A	7	7	21660	21666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017043	ATG	2	6	21672	21677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017043	TAA	2	6	21716	21721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017043	T	8	8	21761	21768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017043	ATT	2	6	22038	22043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017043	ACTT	2	8	22048	22055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017043	A	6	6	22103	22108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017043	A	6	6	22113	22118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017043	ATT	2	6	22126	22131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017043	TATT	2	8	24964	24971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017043	TTA	2	6	24973	24978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017043	ATT	2	6	24983	24988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017043	A	7	7	25004	25010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017043	TAA	2	6	25029	25034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017043	ATTT	2	8	25043	25050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017043	A	7	7	25075	25081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017043	ATT	2	6	25098	25103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017043	ATG	2	6	25124	25129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017043	ATT	2	6	25140	25145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017043	TGT	2	6	25187	25192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017043	ATT	2	6	25233	25238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017043	CTAT	3	12	25270	25281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017043	ATG	2	6	25328	25333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017043	TAG	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017043	ATAA	2	8	25799	25806	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017043	ATT	2	6	25826	25831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017043	A	6	6	25856	25861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017043	TAAT	2	8	25867	25874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017043	AAG	2	6	25963	25968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017043	ATAA	2	8	26041	26048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017043	A	6	6	26083	26088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017043	TAAC	2	8	26095	26102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017043	TAT	2	6	26123	26128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017043	ACATA	2	10	26131	26140	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017043	A	6	6	26155	26160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017043	ATTC	2	8	26194	26201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017043	AAG	2	6	26238	26243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017043	GCA	2	6	26256	26261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017043	TAA	3	9	26387	26395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017043	T	7	7	26396	26402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017043	ATT	2	6	26408	26413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017043	AT	3	6	27225	27230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017043	TA	3	6	27931	27936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017043	GAG	2	6	27941	27946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017043	TAA	2	6	28637	28642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017043	TTA	2	6	28645	28650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017043	TGA	2	6	28667	28672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017043	GAT	2	6	28680	28685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017043	TTA	2	6	28701	28706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017043	TTA	2	6	28796	28801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017043	CTT	2	6	28815	28820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017043	CTG	2	6	28835	28840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017043	T	6	6	28883	28888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017043	ATTG	2	8	28889	28896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017043	ATA	2	6	28959	28964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017043	T	6	6	29133	29138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_017043	TAA	2	6	29218	29223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_017043	T	6	6	29280	29285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017043	TA	3	6	29319	29324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017043	TAA	2	6	29683	29688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017043	TAT	3	9	29718	29726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017043	T	6	6	30281	30286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017043	ATG	2	6	30523	30528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017043	CAT	2	6	30549	30554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_017043	T	6	6	31382	31387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_017043	TAA	3	9	31406	31414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017043	TAA	2	6	31430	31435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017043	AAC	2	6	33223	33228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
198	NC_017043	A	7	7	33263	33269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_017043	TATAT	2	10	47390	47399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017043	TAA	2	6	47403	47408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017043	AT	3	6	49795	49800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_017043	TAC	2	6	50080	50085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_017043	T	7	7	50250	50256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017043	CGT	2	6	50264	50269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017043	TTG	2	6	50402	50407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017043	A	6	6	50409	50414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_017043	CAT	2	6	50497	50502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_017043	ATT	2	6	50513	50518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_017043	TCA	2	6	69359	69364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_017043	TGT	2	6	69441	69446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_017043	TA	3	6	79953	79958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_017043	A	6	6	79988	79993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_017043	A	6	6	83347	83352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017043	T	6	6	83357	83362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017043	TTTAT	2	10	83368	83377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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